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洋葱S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因的克隆及分析

大C-会员头像-www.bzwz.com标准物质网 大C 0 317 2021-07-11
【摘要】根据洋葱转录组测序结果设计了S一腺苷甲硫氨酸合成酶基因(AcSAMS)引物,利用RT—PCR技术和RACE技术克隆了洋葱s一腺苷甲硫氨酸合成酶基因的eDNA全长,命名为AcSAMS。该eDNA全长1475bp,ORF为1191bp,编码396个氨基酸的多肽。生物信息学分析表明,AcSAMS氨基酸序列与紫萼同源性为95%,与短花药野生稻为94%,与桔梗和粳稻为93%。系统发育树结果显示,AcSAMS与唐菖莆SAMS的亲缘关系最近。该基因的克隆可为进一步研究AcSAMS在抗旱、抗冻、耐盐等抗逆过程中的作用机理提供理论依据,为开展抗逆基因工程奠定基础。
  • S-腺苷甲硫氨酸合成酶(S-adenosylmethion-inesynthetase,SAMS,EC:2.5.1.6)是生物体内S-腺苷甲硫氨酸代谢途径中的关键酶,它催化三磷酸腺苷(ATP)和L-甲硫氨酸(Met)反应合成S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)叫,也是目前已.知的生物体内合成SAM的唯一途径。

    SAM是广泛存在于生物中的一-种生理活性分子,也是S-腺苷甲硫氨酸代谢途径关键的中间产物,参与转甲基、转硫、转氨丙基等反应。SAM作为主要的甲基供体,在大多数甲基化反应中起着核心作用,如核酸、蛋白质、脂类和多糖的甲基化回。它参与多种不同的代谢过程,其中主要有合成多胺(精胺、亚精胺和腐胺等)、乙烯及谷胱甘肽。此外,SAM还可与RNA结合参与体内基因表达的调控。因此,研究SAMS基因功能对植物具有重要的意义。

    目前,多种植物中SAMS的cDNA已被克隆出来,如拟南芥、小麦凹、杨树、石蒜叫、芜菁、松树、大白菜、芥菜和杜梨,但是未见洋葱SAMS基因的报道。由于SAMS的重要生物学功能,存在多种类型的SAMS基因,它由一个多基因家族所编码,共同调节着SAM的合成速率。因此,克隆不同物种的SAMS基因具有重要的意义。洋葱(Allium(cepaL.)为葱科(Liliaceae)葱属(Allium)2年生草本蔬菜作物,是重要的世界性蔬菜,也是我国主要栽培和出口蔬菜品种,具有较强的抗冻、抗旱能力。

    本研究拟以洋葱为材料,克隆SAMS基因,并对其序列特征进行分析,旨在为研究AcSAMS在洋葱抗旱和耐冻过程中的作用机理提供理论依据,为开展洋葱抗性分子育种奠定基础。

    1材料和方法

    1.1材料

    以红皮洋葱叶片为材料提取RNA。根据洋葱转录组测序获得的SAMS基因的中间片段序列,设计了RACE引物。本研究所需引物如表1所示。

    1.2总RNA提取及第1链cDNA合成

    用多糖多酚植物RNA提取试剂盒(北京华越洋生物科技有限公司)提取洋葱叶片总RNA。提取总RNA的操作步骤按照试剂盒的说明书进行。利用B26作为引物,以3μg总RNA作为模板,合成cDNA第1链。第1链eDNA合成的反应体系及具体操作步骤参照PrimeSeriptII1*StrandeDNASynthesisKit(TaKaRa)说明书进行。

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