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绿原酸具有抗病毒作用，对流感病毒、呼吸道合胞病毒、疱疹病毒、肠道病毒、H5N1病毒、腺病毒和乙型肝炎病毒均有明显抑制作用。关于绿原酸抗病毒的机理还不是很清楚，根据文献报道，推测绿原酸的抗病毒机制可能与以下二点有关：
1、绿原酸可以抑制病毒表面酶的活性。Karar等研究指出，神经氨酸酶是流感病毒被膜上的一种糖蛋白，具有抗原性，能催化糖苷水解，协助成熟的病毒颗粒脱离宿主细胞并感染新的细胞，造成流感病毒在体内继续扩散。绿原酸、酚酸和衍生物对产气荚膜杆菌、H5N1和重组H5N1N端组氨酸标签的神经氨基酶有抑制活性的作用。绿原酸通过与神经氨酸酶结合，达到抑制病毒在动物体内扩散的目的。
2、绿原酸的抗病毒活性与其自身含有的邻苯二酚基团有关，Ikeda等研究发现，可能是由于绿原酸水解出的具有邻苯二酚基团的咖啡酸，而咖啡酸能抑制疱疹病毒的活性，干扰疱疹病毒DNA的复制，从而发挥抗病毒的作用。
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